Zgodba je postavljena v čas pred animirano serijo, na planet Transformerjev, Cybertron. Zgodba o kateri so ljubitelji franšize že velikokrat slišali, se bo odvila pred njihovimi očmi. Državljanska vojna Transformerjev. Planet je v razsulu. Decepticoni, pod vodstvom Megatrona, želijo zavladati Cybertronu in vzpostaviti red po svojih željah, za kar so pripravljeni storiti karkoli. V veliko pomoč bi jim bila posebna vrsta Energona, imenovanega Dark Energon, ki ga varuje robot Starscream (Energon je glavni vir energije Transformerjem). Na drugi strani so branitelji, pod vodstvom neizkušenega Optimusa, ki je po smrti Zeta Primea prevzel vlogo vodje Autobotov. Ko izve za načrt Megatrona, se skupaj z drugimi Autoboti odloči preprečiti mu dobiti Dark Energon.

Ob nakupu darilo Transformers War for Cybertron figura iz omejene serije: